【蠟筆小新電影系列】30週年紀念作品，小新一行人遇上了忍者！？ 「新之助」在廣志和美冴的家庭中出生5年。過著有如暴風雨般刺激又和平的每一天，可是某天，一名自稱屁祖隱千代女的女性來到了野原家。她告訴眾人：「其實我是新之助真正的母親。」而她身邊站著一位名叫珍藏的5歲少年。突如其來的事件讓野原一家非常困惑，但也不能將他們趕回去，只好讓他們兩個留下來過夜。可是，那天晚上，神秘的忍者軍團突然襲擊了野原家！原來千代女是從忍者村逃出來的女忍者，正被人追捕中！忍者軍團認為小新是她的兒子，所以也將小新一起抓走了。為了拯救兩人，野原一家也正式踏上一段前往忍者村的旅程。